離子色譜儀在大氣環境檢測中主要是對大氣中的氯化氫和硫酸霧有害氣體的含量進行檢測。在正常的環境下，氯化氫和硫酸霧在大氣中的含量十分穩定，但是，如果在自燃現象中有更多的垃圾存儲或傾倒垃圾的地方，那么此時空氣中氯化氫的含量將大大增加，氯化氫的濃度將迅速上升，對大氣的影響將很大。附近的環境破壞也愈加嚴重，對附近的居民的身體健康以及動植物的生長有著很大危害。一般的傳統的大氣環境檢測方法是化學監測方法，這種方法的缺陷就是不能及時對大氣中氯化氫變化做出判斷，而采用離子色譜儀能夠彌補這一缺陷，能夠對大氣中的氯化氫含量的變化及時進行檢測分析，這樣離子色譜儀就可以為大氣檢測的有關部門進行采取合理的應對措施提供準確的數據信息。
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