與前兩類干擾峰相比，
高效液相色譜儀液相系統干擾峰的解決更加困難。液相系統是一個動態過程，所以此類問題解決過程耗費時間長，而且要求實驗人員有很高的色譜素養。對此類問題來源主要歸結為三類：強保留物質、離子對污染和管路滋生細菌。
首先是
高效液相色譜儀強保留物質的干擾，其主要特征是寬峰。此類問題多數發生在等度洗脫中，梯度洗脫主要出現在高比例有機相處。這是由于強保留物質在當次進樣中未洗脫出，在后續進樣洗脫出來所致。對于此類干擾峰，可通過延長采集時間或增加洗脫強度來消除對后續樣品的干擾。至于如何延長采集時間，讀者可通過下面的公式計算得到。
N＝5.54*(tR/Wb/2)^2
由以上公式推導可知
tR＝Wb/2 *(N/5.54)^(1/2)
N-塔板數，在等度洗脫中N對所有峰相同
tR-保留時間
Wb/2-色譜峰半峰寬
盡管按照此公式計算會有一定誤差，但這足以讓
高效液相色譜儀工作者對其進行預判，設置合理的采集時間。
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