②高效液相色譜儀流動相不應含有任何腐蝕性物質，含有緩沖液的流動相不應保留在泵內，尤其是在停泵過夜或更長時間的情況下。如果將含緩沖液的流動相留在泵內，由于蒸發或泄漏，甚至只是由于溶液的靜置，就可能析出鹽的微細晶體，這些晶體將和上述固體微粒一樣損壞密封環和柱塞等。因此，高效液相色譜儀必須泵入純水將泵充分清洗后，再換成適合于色譜柱保存和有利于泵維護的溶劑（對于反相鍵合硅膠固定相，可以是甲醇或甲醇-水）。 
③高效液相色譜儀泵工作時要留心防止溶劑瓶內的流動相被用完，否則空泵運轉也會磨損柱塞、缸體或密封環，最終產生漏液。
 
④高效液相色譜儀輸液泵的工作壓力決不要超過規定的最高壓力，否則會使高壓密封環變形，產生漏液。
 
⑤流動相應該先脫氣，以免在泵內產生氣泡，影響流量的穩定性，如果有大量氣泡，高效液相色譜儀泵就無法正常工作。
 
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