液相色譜儀流動相內產生都無法清除不斷產生的氣泡，主要是因為液相色譜儀過濾器長期沉浸于乙酸銨等緩沖液內，過濾器內部由于霉菌的生長繁殖，形成菌團，阻塞了過濾器，緩沖液難以流暢地通過過濾器，空氣在液相色譜儀泵的壓力作用下經過濾器進入流動相。解決辦法：
液相色譜儀過濾器浸泡于5%硝酸溶液中，超聲清洗幾分鐘即可；亦可將液相色譜儀過濾器浸泡于5%硝酸溶液中12～36小時，輕輕震蕩幾次，再將過濾器用純水清洗幾次，打開泄壓閥，打開purge鍵清洗脫氣，如仍有氣泡不斷從過濾器冒出，繼續將過濾器浸泡于5%硝酸溶液中，如沒有氣泡不斷從過濾器中冒出，說明過濾器內部的霉菌菌團已被硝酸破壞，流動相可以流暢地通過過濾器。打開泄壓閥，打開泵，流速調至1.0～3.0ml/min，純水沖洗過濾器1小時左右。即可將液相色譜儀過濾器清洗干凈。關閉泄壓閥，純甲醇沖洗半小時即可。
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