流動注射分析儀蠕動泵由驅動電機、泵頭、壓蓋或帶、壓力調節裝置和泵管幾部分組成。常用的電機有同步電機、可逆電機和步進電機。泵頭由滾柱組成的滾輪‚要求用耐磨和耐腐蝕材料精密加工制成。滾輪與電機的轉軸要求嚴格同心。壓蓋分為多道一體式、分道式和壓帶式。前兩種對壓蓋的曲率要求很高。壓力調節裝置要求易調和調后不自行變化。泵管最常用的是聚氯乙烯‚又稱泵管和硅橡膠泵骨。
流動注射分析儀蠕動泵的工作原理是泵管在泵頭和壓蓋之間連續受到擠壓，使泵管具有吸液和輸液的功能。流速是由泵頭的轉速、泵管的內徑和壓蓋的壓緊程度決定的。蠕動泵價格比較便宜‚能滿足的要求。目前
流動注射分析儀最常采用的就是蠕動泵，但它只適用系統壓力比較小的情況。
流動注射分析儀對于流速要求高以及系統壓力比較大的情況，多數選用注射泵。其基本結構是固定在支架上的螺旋桿由步進電機驅動，螺旋桿后退時帶動注射器活塞后退，吸取液體反之將吸入的液體推到管路中去。由于螺旋桿在電機的驅動下做勻速轉動‚所以
流動注射分析儀可獲得極其穩定的流速，并可承受較大的壓力，其缺點是價格高，且只能帶動一個流路。
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